Евгений Баулин

  • Евгений Баулин

    Ассистент

    Руководитель курса «Алгоритмы биоинформатики».

    • 2008-2009, СУНЦ МГУ — Школа им. А. Н. Колмогорова.
    • 2009-2013, Бакалавриат НИУ ВШЭ, Отделение прикладной математики и информатики.
    • 2013-2015, Магистратура ПущГЕНИ, Прикладная математика и информатика.
Контакты

 

Публикации
  1. Baulin, E., Yacovlev, V., Khachko, D., Spirin, S., & Roytberg, M. (2016). URS DataBase: universe of RNA structures and their motifs. Database, 2016, baw085.
  2. Zanegina O, Kirsanov D, Baulin E, Karyagina A, Alexeevski A, Spirin S. (2015). An updated version of NPIDB includes new classifications of DNA-protein complexes and their families. Nucleic Acids Research. doi: 10.1093/nar/gkv1339
  3. Baulin E.F., Korinevskaya A.V., Roytberg M.A. Long-range stem-based RNA tertiary motifs. In: Proceedings of Moscow Conference on Computational Molecular Biology (July 16-19, 2015. Moscow). 2015.
  4. Баулин Е. Ф., Ройтберг М. А. Стемовые мультиплеты: новый подход к описанию третичных мотивов РНК // Математическая биология и биоинформатика. 2015. Т. 10. № 1. С. 54-59. doi: 10.17537/2015.10.54
  5. Baulin E.F., Spirin S., Roytberg M.A. Analysis and Classification of Nonstandard RNA Motifs, in: Abstracts of the Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB, June 23-28, 2014). Novosibirsk: Publishing House SB RAS, 2014. P. 27.
  6. Баулин Е.Ф., Спирин С., Ройтберг М.А. Поиск элементов структур РНК // В кн.: Математическая биология и биоинформатика: V Международная конференция, г. Пущино, 19-24 октября 2014 г.: Доклады. М.: МАКС Пресс, 2014. С. 78-79.
  7. Baulin E.F., Roytberg M.A. The database of RNA secondary structure elements. In: Proceedings of Moscow Conference on Computational Molecular Biology (July 25-28, 2013. Moscow). 2013.
  8. Баулин Е. Ф., Ройтберг М. А., Астахова Т. В. Классификация элементов вторичной структуры РНК // Математическая биология и биоинформатика. 2012. Т. 7. № 2. С. 567-571. URL: http://www.matbio.org/2012/Baulin_7_567.pdf
  9. Baulin E., Ivankov D., Roytberg M. Statistics of RNA structures. In: Proceedings of Moscow Conference on Computational Molecular Biology (July 21-24, 2011. Moscow). 2011. P. 325-326.
Достижения
Работа и преподавание
  • ИМПБ РАН — филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Младший научный сотрудник
  • Факультатив по математике, Средняя школа №1, г.Пущино, Московская область
  • Участие в проведении Зимней Пущинской школы (ЗПШ)

Является основным разработчиком базы данных пространственных структур РНК URSDB. На данный момент проект развивается в следующих направлениях:

Разработка неизбыточного подмножества структур РНК, необходимого для проведения статистического анализа;

Интеграция новых собственных и сторонних сервисов аннотации и визуализации структур РНК;

Поиск закономерностей строения структуры РНК, в частности анализ третичных мотивов.

Научные интересы
  • Прикладная математика
  • Структурная биоинформатика
  • Биология клетки
  • Алгоритмика
  • Анализ данных